赛文奥特曼X

我们日常生活在一个似是而非的世界，而在大都市的喧闹中，弥漫着一股异常和不安的氛围。那里隐藏着一个和我们居住着的截然不同的世界。这个世界的街头上巡游着无数监视器，传达着政府的意图，给予人们各种各样的情报。这是一个市民被情报支配着的高度管理的社会。
而这个世界已经被来自宇宙的各种各样的生命体、外星人所入侵渗透。他们能拟态成人类的样子，融入自然风景和物质之中，或者潜伏在街头。他们当中有的能理解人类的语言，也有的使用完全不同的通信手段进行沟通。
但是，在他们之中，也有着企图侵略地球，甚至等待机会灭亡人类的物种。介于这种侵略者的存在，为了保卫这个世界，使用尖端科技的搜查小队“DEUS”成立了。DEUS所属的特工们，平时出没在街头，像普通市民一样生活着，一旦接到发生事变的通知就赶赴现场。特工们由多人组成小队来执行任务，他们并不知道彼此的真名，而是以代号互相称呼。
那么，这个世界的本质究竟是什么？还有，想要拯救这个世界的红色巨人“奥特赛文X”到底是什么人呢？这是贯穿整个故事的巨大的谜团。
这个故事的主人公“Jin”是DEUS的特工之一，但是他失去了以前的全部记忆。自己为什么在这里，为什么被称作“Jin”，以及自己的真实身份究竟是？
但是，他无暇思考，就被卷入了与外星人的战斗。他从迷之女子艾丽娅那里收到的红色眼镜又是什么呢？
很快，他就会知道一切的真相……